Setelah berakhirnya Operasi Pemusnahan Keluarga Tsukiyama, para anggota Komisi Kontra Hantu (CCG) telah berkembang secara eksponensial dalam kekuasaan dan terus mengejar tujuan mereka untuk memusnahkan setiap hantu di Jepang. Setelah mengundurkan diri dari Quinx Squad, Haise Sasaki yang kini tampak tanpa emosi mulai mengambil lebih banyak tugas dari CCG tanpa mempedulikan kesulitannya. Terlepas dari ekspresinya yang kosong, kenangan Ken Kaneki muncul kembali dalam diri Haise, membuatnya berada dalam kondisi konflik internal. Sementara itu, perilaku barunya yang dingin mempengaruhi orang-orang di sekitarnya. Quinx Squad dibiarkan berantakan, harus menghadapi kematian salah satu anggota mereka tanpa dukungan dari mantan mentor mereka.
Di tengah kegalauan tersebut, baik Quinx Squad maupun Haise harus tetap memenuhi tugas mereka kepada CCG, mau tidak mau. Namun, keberadaan kelompok misterius di belakang CCG telah diketahui oleh Haise, dan bisikan-bisikan korupsi juga tidak luput dari perhatian Quinx Squad.
